MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Fibrella aestuarina BUZ 2 drat genome

Total Repeats: 123422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_020054	GAT	3	9	152747	152755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833512
3002	NC_020054	GTT	2	6	152834	152839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833512
3003	NC_020054	CTTT	2	8	152896	152903	0 %	75 %	0 %	25 %	436833512
3004	NC_020054	ACC	2	6	152931	152936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833512
3005	NC_020054	CGA	2	6	153019	153024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833512
3006	NC_020054	GGT	3	9	153086	153094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833512
3007	NC_020054	TCG	2	6	153150	153155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833512
3008	NC_020054	GCG	2	6	153211	153216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833512
3009	NC_020054	CGC	2	6	153234	153239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833512
3010	NC_020054	CTG	2	6	153248	153253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833512
3011	NC_020054	CAC	2	6	153257	153262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833512
3012	NC_020054	TGG	2	6	153388	153393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833512
3013	NC_020054	CAG	2	6	153410	153415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833512
3014	NC_020054	CTG	2	6	153467	153472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833512
3015	NC_020054	ACAG	2	8	153513	153520	50 %	0 %	25 %	25 %	436833512
3016	NC_020054	GTTGAT	2	12	153937	153948	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	436833513
3017	NC_020054	CTG	3	9	154012	154020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833513
3018	NC_020054	CGG	2	6	154023	154028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833513
3019	NC_020054	CAC	2	6	154036	154041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833513
3020	NC_020054	GGC	2	6	154068	154073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833513
3021	NC_020054	CTG	2	6	154096	154101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833513
3022	NC_020054	CAC	2	6	154114	154119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833513
3023	NC_020054	TTCGT	2	10	154130	154139	0 %	60 %	20 %	20 %	436833513
3024	NC_020054	GCTG	2	8	154150	154157	0 %	25 %	50 %	25 %	436833513
3025	NC_020054	CTGG	2	8	154162	154169	0 %	25 %	50 %	25 %	436833513
3026	NC_020054	ACCCG	2	10	154184	154193	20 %	0 %	20 %	60 %	436833513
3027	NC_020054	ACC	3	9	154199	154207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833513
3028	NC_020054	CGTAGA	2	12	154281	154292	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	436833513
3029	NC_020054	A	6	6	154322	154327	100 %	0 %	0 %	0 %	436833513
3030	NC_020054	TTG	2	6	154355	154360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833513
3031	NC_020054	GTT	2	6	154453	154458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833513
3032	NC_020054	AGTT	2	8	154476	154483	25 %	50 %	25 %	0 %	436833513
3033	NC_020054	CGC	2	6	154591	154596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833513
3034	NC_020054	TCG	2	6	154667	154672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833513
3035	NC_020054	GCCG	2	8	154686	154693	0 %	0 %	50 %	50 %	436833513
3036	NC_020054	TGC	2	6	154730	154735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833513
3037	NC_020054	TTG	2	6	154753	154758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833513
3038	NC_020054	CAG	3	9	154771	154779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833513
3039	NC_020054	CGA	2	6	155173	155178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833514
3040	NC_020054	TCT	2	6	155188	155193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436833514
3041	NC_020054	CCA	2	6	155280	155285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833514
3042	NC_020054	CGA	2	6	155293	155298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833514
3043	NC_020054	TTA	2	6	155307	155312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436833514
3044	NC_020054	AGG	2	6	155325	155330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436833514
3045	NC_020054	CAC	2	6	155356	155361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833514
3046	NC_020054	GGT	2	6	155374	155379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833514
3047	NC_020054	CGG	2	6	155429	155434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833514
3048	NC_020054	GTC	2	6	155449	155454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833514
3049	NC_020054	CCG	2	6	155496	155501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833514
3050	NC_020054	AGC	2	6	155541	155546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833514
3051	NC_020054	GCA	2	6	155581	155586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833514
3052	NC_020054	CAC	2	6	155722	155727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833514
3053	NC_020054	CTGG	2	8	155728	155735	0 %	25 %	50 %	25 %	436833514
3054	NC_020054	GC	3	6	155795	155800	0 %	0 %	50 %	50 %	436833515
3055	NC_020054	TGA	2	6	155815	155820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833515
3056	NC_020054	CGG	2	6	155932	155937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833515
3057	NC_020054	GCA	2	6	155950	155955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833515
3058	NC_020054	CGG	2	6	155968	155973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833515
3059	NC_020054	CAG	2	6	155981	155986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833515
3060	NC_020054	AGC	2	6	156024	156029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833515
3061	NC_020054	CAC	2	6	156056	156061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833515
3062	NC_020054	GGTTC	2	10	156179	156188	0 %	40 %	40 %	20 %	436833515
3063	NC_020054	GCC	2	6	156287	156292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833515
3064	NC_020054	TCG	2	6	156303	156308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833515
3065	NC_020054	GCC	2	6	156317	156322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833515
3066	NC_020054	AACA	2	8	156341	156348	75 %	0 %	0 %	25 %	436833515
3067	NC_020054	TCG	2	6	156366	156371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833515
3068	NC_020054	GATGTT	2	12	156404	156415	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	436833515
3069	NC_020054	CCG	2	6	156466	156471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833515
3070	NC_020054	TCT	2	6	156499	156504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436833515
3071	NC_020054	GCA	2	6	156517	156522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833515
3072	NC_020054	TTC	2	6	156534	156539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436833515
3073	NC_020054	ACC	2	6	156546	156551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833515
3074	NC_020054	ACG	2	6	156600	156605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833515
3075	NC_020054	ACCGC	2	10	156673	156682	20 %	0 %	20 %	60 %	436833515
3076	NC_020054	CGGCG	2	10	156755	156764	0 %	0 %	60 %	40 %	436833515
3077	NC_020054	GTT	2	6	156767	156772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833515
3078	NC_020054	C	6	6	156773	156778	0 %	0 %	0 %	100 %	436833515
3079	NC_020054	CGG	2	6	156874	156879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833515
3080	NC_020054	CAT	2	6	156919	156924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833515
3081	NC_020054	GCA	2	6	156940	156945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833515
3082	NC_020054	GAT	2	6	156953	156958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833515
3083	NC_020054	TTC	2	6	156993	156998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436833515
3084	NC_020054	TCG	2	6	157009	157014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833515
3085	NC_020054	TGA	2	6	157081	157086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833515
3086	NC_020054	TTG	2	6	157110	157115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833515
3087	NC_020054	CGCC	2	8	157158	157165	0 %	0 %	25 %	75 %	436833515
3088	NC_020054	GCC	3	9	157175	157183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833515
3089	NC_020054	GCC	2	6	157226	157231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833515
3090	NC_020054	CAG	2	6	157298	157303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833515
3091	NC_020054	GCG	2	6	157366	157371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833515
3092	NC_020054	GCG	2	6	157407	157412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833515
3093	NC_020054	GGC	2	6	157454	157459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833515
3094	NC_020054	GCC	2	6	157493	157498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833515
3095	NC_020054	TGT	2	6	157552	157557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833515
3096	NC_020054	GTT	3	9	157601	157609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833515
3097	NC_020054	GCGG	2	8	157613	157620	0 %	0 %	75 %	25 %	436833515
3098	NC_020054	CTG	2	6	157688	157693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833515
3099	NC_020054	CGG	2	6	157705	157710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833515
3100	NC_020054	TGC	2	6	157772	157777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833515
3101	NC_020054	CGAC	2	8	157825	157832	25 %	0 %	25 %	50 %	436833515
3102	NC_020054	GTC	2	6	157897	157902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833515
3103	NC_020054	TTG	2	6	157935	157940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833515
3104	NC_020054	GCC	2	6	157985	157990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833515
3105	NC_020054	GAC	2	6	157997	158002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833515
3106	NC_020054	CG	3	6	158008	158013	0 %	0 %	50 %	50 %	436833515
3107	NC_020054	TGG	3	9	158056	158064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833515
3108	NC_020054	CA	3	6	158071	158076	50 %	0 %	0 %	50 %	436833515
3109	NC_020054	ACT	2	6	158320	158325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833516
3110	NC_020054	AGC	2	6	158357	158362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833516
3111	NC_020054	T	6	6	158370	158375	0 %	100 %	0 %	0 %	436833516
3112	NC_020054	CGG	2	6	158438	158443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833516
3113	NC_020054	CCG	2	6	158453	158458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833516
3114	NC_020054	GCA	2	6	158490	158495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833516
3115	NC_020054	CTT	2	6	158505	158510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436833516
3116	NC_020054	ACT	2	6	158531	158536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833516
3117	NC_020054	CAT	2	6	158674	158679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833517
3118	NC_020054	GCCA	2	8	158689	158696	25 %	0 %	25 %	50 %	436833517
3119	NC_020054	T	6	6	158714	158719	0 %	100 %	0 %	0 %	436833517
3120	NC_020054	GCC	2	6	158729	158734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833517
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3149	NC_020054	AGC	2	6	159959	159964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833518
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3161	NC_020054	CGG	2	6	160354	160359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833519
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3234	NC_020054	GAT	2	6	164002	164007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833522
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3240	NC_020054	GAA	2	6	164328	164333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436833523
3241	NC_020054	CAG	2	6	164380	164385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833523
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3353	NC_020054	CG	3	6	170455	170460	0 %	0 %	50 %	50 %	436833526
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3358	NC_020054	CCG	2	6	170706	170711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833526
3359	NC_020054	ACC	2	6	170724	170729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833526
3360	NC_020054	ACAGG	2	10	170762	170771	40 %	0 %	40 %	20 %	436833526
3361	NC_020054	CTG	2	6	170778	170783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833526
3362	NC_020054	CGG	2	6	170803	170808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833526
3363	NC_020054	CCT	2	6	170813	170818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436833526
3364	NC_020054	ACG	2	6	170833	170838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833526
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3366	NC_020054	GAA	2	6	170954	170959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436833526
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3369	NC_020054	GCT	2	6	171059	171064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833526
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3373	NC_020054	CGT	2	6	171185	171190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833526
3374	NC_020054	CGA	2	6	171194	171199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833526
3375	NC_020054	CTG	2	6	171224	171229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833526
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3384	NC_020054	CGA	2	6	171491	171496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833526
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3390	NC_020054	AGC	2	6	171679	171684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833526
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3392	NC_020054	GCA	2	6	171814	171819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833526
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3462	NC_020054	GCC	2	6	175515	175520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833531
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3469	NC_020054	GTA	2	6	175664	175669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833531
3470	NC_020054	TCG	2	6	175683	175688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833531
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3472	NC_020054	TCG	2	6	176025	176030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833531
3473	NC_020054	TGT	2	6	176059	176064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833531
3474	NC_020054	TCG	2	6	176136	176141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833531
3475	NC_020054	GTT	2	6	176153	176158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833531
3476	NC_020054	CCT	2	6	176188	176193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436833531
3477	NC_020054	CGC	2	6	176279	176284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833531
3478	NC_020054	GGCG	2	8	176348	176355	0 %	0 %	75 %	25 %	436833531
3479	NC_020054	CGGTG	2	10	176372	176381	0 %	20 %	60 %	20 %	436833531
3480	NC_020054	GAG	2	6	176444	176449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436833532
3481	NC_020054	GCG	2	6	176450	176455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833532
3482	NC_020054	AAC	2	6	176465	176470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833532
3483	NC_020054	GCA	2	6	176492	176497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833532
3484	NC_020054	CA	3	6	176557	176562	50 %	0 %	0 %	50 %	436833532
3485	NC_020054	TGA	2	6	176741	176746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833533
3486	NC_020054	GTG	2	6	176774	176779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833533
3487	NC_020054	CCGTGG	2	12	176780	176791	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	436833533
3488	NC_020054	CGC	2	6	176903	176908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833533
3489	NC_020054	TGG	2	6	177044	177049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833533
3490	NC_020054	AAG	2	6	177100	177105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436833533
3491	NC_020054	TGC	2	6	177251	177256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833533
3492	NC_020054	CATG	2	8	177264	177271	25 %	25 %	25 %	25 %	436833533
3493	NC_020054	GC	3	6	177290	177295	0 %	0 %	50 %	50 %	436833533
3494	NC_020054	TCG	2	6	177337	177342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833533
3495	NC_020054	GAT	2	6	177357	177362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833533
3496	NC_020054	A	6	6	177373	177378	100 %	0 %	0 %	0 %	436833533
3497	NC_020054	TGG	2	6	177395	177400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833533
3498	NC_020054	AGC	2	6	177443	177448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833533
3499	NC_020054	GTC	2	6	177501	177506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833533
3500	NC_020054	GCA	2	6	177516	177521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833533

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